Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIRT1Q96EB6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms