Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms