Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLHL12Q53G59 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms