Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CAMK2DQ13557 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms