Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms