Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms