Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCND2P30279 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCND2P30279 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCND2P30279 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms