Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
APOC3P02656 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms