Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DQB1P01920 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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