Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms