Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCDHA12Q9UN75 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms