Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMC2Q15006 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMC2Q15006 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms