Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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