Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT88Q13099 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms