Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SRSF2Q01130 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SRSF2Q01130 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms