Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P62684 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms