Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms