Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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