Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms