Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms