Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCAP01258 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCAP01258 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCAP01258 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCAP01258 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms