Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF40O75150 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF40O75150 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF40O75150 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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