Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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