Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CC2D2AQ9P2K1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms