Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms