Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms