Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms