Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms