Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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