Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SSX1Q16384 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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