Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL23P55773 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL23P55773 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms