Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms