Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFC1P35251 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFC1P35251 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms