Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFNP31947 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFNP31947 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFNP31947 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms