Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB8P17481 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms