Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNB1P01574 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms