Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKAP2O75563 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms