Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC9O60706 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms