Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms