Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNMT3BQ9UBC3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms