Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LNPKQ9C0E8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms