Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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