Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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