Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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