Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RASSF3Q86WH2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASSF3Q86WH2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms