Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms