Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF239Q16600 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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