Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms