Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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AP3B2Q13367 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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AP3B2Q13367 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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AP3B2Q13367 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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