Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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